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m6A研究又有新手段了?趕緊來了解一下吧!欄目:研究動(dòng)態(tài)發(fā)布時(shí)間:2019-08-14RNA甲基化m6A是如今的研究熱點(diǎn)之一,Cell上新發(fā)表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測(cè)mRNAm6A水平的Resource文章......RNA甲基化m6A是如今的研究熱點(diǎn)之一,目前主要的研究思路包括差異表達(dá)的write,reader和eraser基因分析;m6A抗體檢測(cè)全轉(zhuǎn)錄組甲基化水平;分析m6A甲基化水平變化的靶基因和下游機(jī)制研究。而在7月25日的Cell上新發(fā)表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測(cè)mRNAm6A水平的Resource文章,小編時(shí)間和大家分享一下。作者開發(fā)這一方法的前提是有研究報(bào)道了MazF能特異性的識(shí)別無修飾的ACA序列并發(fā)揮RNA酶活性在ACA之前剪切底物。但ACA序列的個(gè)A發(fā)生m6A甲基化之后將無法被MazF所識(shí)別,如圖一所示。圖1MazFRNA酶作用示意圖根據(jù)這一原理,作者將純化后的mRNA進(jìn)行MazF酶處理,然后再對(duì)打斷的RNA進(jìn)行逆轉(zhuǎn)建庫測(cè)序。對(duì)于無修飾的位點(diǎn),ACA處被完全剪切,測(cè)序reads正好分布于該位點(diǎn)上下游而且比對(duì)至該處的上下游reads數(shù)是相同的.如圖2所示。而甲基化位點(diǎn)的reads會(huì)包含上下游的序列。作者開發(fā)了MAZTER-MINE軟件包專門進(jìn)行分析(圖3)。細(xì)胞培養(yǎng)板的選購(gòu)要注意哪些?貴州疾病模型科研技術(shù)服務(wù)外包
膿毒癥動(dòng)物模型必須具備以下基本要素:有膿毒癥典型的高排低阻血流動(dòng)力學(xué)表現(xiàn)和高代謝狀態(tài);伴發(fā)多個(gè)功能障礙;有較高的自然死亡率,根據(jù)膿毒癥的轉(zhuǎn)歸,要求動(dòng)物模型的自然死亡率達(dá)到50%~70%;膿毒癥是嚴(yán)重引起機(jī)體的炎癥反應(yīng)過度造成的自身損傷,不是細(xì)菌和內(nèi)對(duì)機(jī)體的直接損傷,故出現(xiàn)功能障礙及動(dòng)物死亡距膿毒癥模型制備應(yīng)有一定的時(shí)間間距。一般在制模后6~12h后發(fā)生的功能障礙或死亡屬全身炎癥反應(yīng)所致。實(shí)驗(yàn)動(dòng)物的選擇在制作動(dòng)物模型時(shí)多選用雄性小鼠,因?yàn)榇菩孕∈筝^雄性小鼠更能耐受膿毒癥和失血性休克,且進(jìn)入發(fā)期的雌性小鼠性水平變化很大,而雄性小鼠在膿毒癥時(shí)更易于發(fā)生免疫抑制。為什么選擇CLP模型?盲腸結(jié)扎穿孔模型(CLP)模型是接近于人類膿毒癥機(jī)制的模型,被稱為膿毒癥模型的“金標(biāo)準(zhǔn)”。CLP技術(shù)在20世紀(jì)70年代被建立。CLP模型非常適宜用于防治膿毒癥或膿毒性休克新藥的臨床前觀察造模方法CLP膿毒癥模型的建立主要分為兩個(gè)階段:盲腸遠(yuǎn)端結(jié)扎和盲腸穿刺。首先是手術(shù)引發(fā)的結(jié)扎部位組織變性壞死引起局部炎癥反應(yīng),其次是穿孔后使糞便內(nèi)容物漏入腹膜引起多菌性細(xì)菌性腹膜炎,進(jìn)而誘發(fā)全身性炎癥反應(yīng)。北京小鼠科研技術(shù)服務(wù)實(shí)驗(yàn)protocol 分享|小鼠卵巢組織切片 HE 染色。
中華文化促進(jìn)會(huì)文化創(chuàng)新與傳播委員會(huì)會(huì)長(zhǎng)朱建聲、西安海棠學(xué)院院長(zhǎng)馮居秦、西安交通大學(xué)人文學(xué)院EDP中心主任、中華風(fēng)采人物媒體社長(zhǎng)王天保、西安市EMBA助企商會(huì)會(huì)長(zhǎng)張西安、陜西省糖尿病協(xié)會(huì)副會(huì)長(zhǎng)張麗、陜西省養(yǎng)生協(xié)會(huì)會(huì)長(zhǎng)李靖、陜西省職業(yè)經(jīng)理人協(xié)會(huì)名譽(yù)會(huì)長(zhǎng)劉志超、西藏鷹山科技集團(tuán)董事長(zhǎng)張沛、西安天歌干細(xì)胞健康管理中心總經(jīng)理楊海軍和團(tuán)隊(duì)及各行各業(yè)企業(yè)界朋友、受益者近200人參與了活動(dòng)。西安天歌干細(xì)胞健康管理有限公司總經(jīng)理楊海軍介紹了成立一年來的工作情況和未來的發(fā)展布局。隨后,天歌干細(xì)胞健康管理中心負(fù)責(zé)人分別同中華文化促進(jìn)會(huì)文化創(chuàng)新與傳播委員會(huì)會(huì)長(zhǎng)朱建聲;西安市(EMBA助企商會(huì))/西安市EMBA商會(huì)會(huì)長(zhǎng)張西安;鄭州天歌干細(xì)胞健康管理有限公司總經(jīng)理張永紅和上海豪景醫(yī)療器械有限公司總經(jīng)理張建國(guó)進(jìn)行了簽約儀式。主持人同中華風(fēng)采人物媒體社長(zhǎng)、新時(shí)代風(fēng)采人物研究會(huì)會(huì)長(zhǎng)、文化名人收藏大家王天保,中華風(fēng)采人物媒體主編李西紅,西藏鷹山科技集團(tuán)董事長(zhǎng)張沛分別從幾個(gè)話題闡述和討論了大健康產(chǎn)業(yè)的未來前景。為了答謝各界朋友的的支持與厚愛,活動(dòng)舉行了現(xiàn)場(chǎng)抽獎(jiǎng)環(huán)節(jié),將活動(dòng)掀起了高潮。通過活動(dòng)一方面讓大家和身邊的朋友更關(guān)注健康。
首先,預(yù)實(shí)驗(yàn)必須要當(dāng)做正式實(shí)驗(yàn)來對(duì)待(態(tài)度要放端正,這是必須的)。預(yù)實(shí)驗(yàn)的每一步都需要詳細(xì)規(guī)劃,多方籌謀。不論是實(shí)驗(yàn)動(dòng)物的選擇,還是檢測(cè)試劑的購(gòu)買,都盡量和正式實(shí)驗(yàn)統(tǒng)一標(biāo)準(zhǔn)。建議大家先把所有試劑和購(gòu)買完畢后,再去購(gòu)買實(shí)驗(yàn)動(dòng)物。因?yàn)閯?dòng)物會(huì)長(zhǎng)胖,長(zhǎng)胖后給劑量就要增加,不僅多花錢,并且還容易影響實(shí)驗(yàn)效果。筆者曾經(jīng)提前將實(shí)驗(yàn)動(dòng)物買回,但因?yàn)樘厥庠驔]能購(gòu)買到造模,終只能忍痛割愛將動(dòng)物贈(zèng)送他人,白白虧了一筆血汗錢(那批老鼠在我這兒白吃白喝長(zhǎng)得太胖,沒辦法用作造模)。動(dòng)物及試劑購(gòu)買首先需要考慮:實(shí)驗(yàn)動(dòng)物品種、體重、性別、周齡(通常根據(jù)既往文獻(xiàn)報(bào)道可以獲得答案)、數(shù)量(需要考慮到實(shí)驗(yàn)有一定動(dòng)物死亡率或者動(dòng)物本身會(huì)打架互毆,因此需要提前購(gòu)買足夠的動(dòng)物)。動(dòng)物購(gòu)買的途徑、安置的地點(diǎn),飲食管理(一般實(shí)驗(yàn)室會(huì)有動(dòng)物房,也可以從其他地方購(gòu)買),動(dòng)物免證明、倫理證明需要提前準(zhǔn)備好。實(shí)驗(yàn)相關(guān)的試劑和:比如造模和,動(dòng)物干預(yù)所需,陽性選擇及購(gòu)買(有些購(gòu)買很困難,必須通過特殊程序才能買到)。如果涉及到有創(chuàng)操作,要提前準(zhǔn)備好(建議提前購(gòu)買),手術(shù)。需要了解自身實(shí)驗(yàn)平臺(tái)能完成哪些技術(shù)。動(dòng)物疾病模型在科研中有著普遍的應(yīng)用。
保存于嚴(yán)密緊塞或加蓋的容器里,同時(shí)在容器外上標(biāo)簽,并隨同材料在溶液中投入相應(yīng)的標(biāo)簽,以免相互混淆。標(biāo)簽上注明固定液、材料來源、日期等。標(biāo)簽上的文字,應(yīng)用黑色鉛筆或繪圖黑墨水書寫。3.脫水注意事項(xiàng)(1)脫水原理:乙醇與石蠟不相溶,而二甲苯既能溶于乙醇又能溶于石蠟。當(dāng)組織中全部被二甲苯占有時(shí),光線可以透過,組織呈現(xiàn)出不同程度的透明狀態(tài)。(2)脫水必須在有蓋的玻璃品中進(jìn)行,防止吸收空氣中的水分。(3)在更換高一級(jí)的脫水劑時(shí),不要移動(dòng)材料以免損壞,可用吸管吸出器皿中的脫水劑,再用吸水吸盡器皿內(nèi)剩余液,然后于皿中加入高一級(jí)脫水劑。(4)在低濃度酒精中,每級(jí)停留不宜太長(zhǎng),否則易使組織變軟,助長(zhǎng)材料的解體。(5)在高濃度或純酒精中,每級(jí)停留的時(shí)間也不宜太長(zhǎng),否則會(huì)使組織變脆,影響切片。(6)如需過夜,應(yīng)停留在70%酒精中。(7)脫水必須徹底,否則不易透明,甚至使透明劑內(nèi)出現(xiàn)白色混濁現(xiàn)象。4.透明注意事項(xiàng)(1)使用透明劑時(shí),要隨時(shí)蓋緊蓋子,以免空氣中的水分進(jìn)入。(2)更換每級(jí)透明劑,動(dòng)作要迅速,一方面為了不使材料塊干涸,另一方面能避免吸收濕氣。(3)在透明過程中,如果材料周圍出現(xiàn)白色霧狀,說明材料中的水未被脫凈。protocol 分享|過表達(dá)細(xì)胞株的構(gòu)建。貴州疾病模型科研技術(shù)服務(wù)外包
EdU細(xì)胞增殖檢測(cè)是一種新型的細(xì)胞增殖檢測(cè)方法。貴州疾病模型科研技術(shù)服務(wù)外包
RNA各種可逆的化學(xué)修飾被認(rèn)為是一種新的表觀遺傳調(diào)控方式。m6A是真核生物mRNA常見的化學(xué)修飾,在調(diào)控mRNA穩(wěn)定性,剪切和翻譯方面具有重要的作用。作者使用轉(zhuǎn)錄組測(cè)序發(fā)現(xiàn)了METTL3(甲基轉(zhuǎn)移酶3),一種主要的RNAN6-腺苷-甲基轉(zhuǎn)移酶,在人肝細(xì)胞(HCC)和多種實(shí)體中高表達(dá)。在臨床上,METTL3的過度表達(dá)與肝細(xì)胞患者不良預(yù)有關(guān)。體外實(shí)驗(yàn)證明敲除METTL3會(huì)抑制HCC細(xì)胞增殖,遷移及克隆形成。體內(nèi)實(shí)驗(yàn)證明敲除METTL3會(huì)明顯抑制HCC體內(nèi)成瘤和肺轉(zhuǎn)移。另外,使用CRISPR/dCas9-VP64系統(tǒng),內(nèi)源性高表達(dá)METTL3會(huì)促進(jìn)HCC細(xì)胞在體外和體內(nèi)生長(zhǎng)。通過轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、m6A-Seq、MeRIP-PCR,作者確定了SOCS2(細(xì)胞因子信號(hào)2的抑制因子)作為METTL3介導(dǎo)的m6A修飾的下游靶基因。敲除METTL3表達(dá)會(huì)消除SOCS2mRNAm6A修飾并增強(qiáng)SOCS2mRNA表達(dá)。m6A介導(dǎo)的SOCS2mRNA降解是依賴于m6A“讀取器”蛋白YTHDF2??傊?,METTL3在HCC大部分高表達(dá)中,并通過m6A-YTHDF2依賴機(jī)制抑制SOCS2表達(dá)從而促進(jìn)HCC進(jìn)展。因此,作者發(fā)現(xiàn)了在肝發(fā)生過程中表觀遺傳改變的一種新機(jī)制。圖4RNA甲基化轉(zhuǎn)移酶METLLT3在肝組織中高表達(dá)。貴州疾病模型科研技術(shù)服務(wù)外包