逆轉(zhuǎn)錄過程是病毒的復制形式之一,如RNA病毒中的逆轉(zhuǎn)錄病毒,DNA病毒中的擬逆轉(zhuǎn)錄病毒的復制均需要經(jīng)過逆轉(zhuǎn)錄。逆轉(zhuǎn)錄過程在真核細胞中也同樣存在,例如逆轉(zhuǎn)座子和端粒DNA的延長均存在逆轉(zhuǎn)錄過程,需逆轉(zhuǎn)錄酶的催化,端粒酶即為真核細胞中的逆轉(zhuǎn)錄酶。逆轉(zhuǎn)錄過程的揭示是分子生物學研究中的重大發(fā)現(xiàn),是對中心法則的重要修正和補充。人們通過體外模擬該過程,以樣本中提取的mRNA為模板,在逆轉(zhuǎn)錄酶的作用下,合成出互補的cDNA,構(gòu)建cDNA文庫,并從中篩選特異的目的基因。該方法已成為基因工程技術(shù)中較常用的獲得目的基因的策略之一。逆轉(zhuǎn)錄實驗過程需適當?shù)腞NA質(zhì)量,過少或質(zhì)量不佳將影響擴增效果。一體化逆轉(zhuǎn)錄試劑RNA提取
逆轉(zhuǎn)錄的過程:生物體中的逆轉(zhuǎn)錄過程就比較復雜,比如逆轉(zhuǎn)錄病毒(retrovirus)。病毒是真正的“極簡風”,所有東西都壓縮到非常。比如它的基因組中,經(jīng)常有些基因是重疊、嵌套結(jié)構(gòu),充分利用每一個堿基。所以它也不會專門編碼一個引發(fā)酶來合成引物,它一般是在組裝時帶走宿主的tRNA,在下次侵染時當作引物使用。被用作引物的tRNA會結(jié)合在病毒基因組RNA鏈的中間,所以首先次只能合成出一部分cDNA,然后利用基因組RNA兩端的一段重復序列,“跳”回另一端,完成整條鏈的逆轉(zhuǎn)錄。之后水解RNA鏈的時候,會留下一些片段作為復制的引物。雙鏈DNA的合成同樣也需要經(jīng)過一次跳躍(jump),以合成完整雙鏈。較后兩端具有相同的序列,稱為長末端重復(longterminalrepeats,LTR)。LTR不只包含跳躍時用來配對的序列,還有整合信號、啟動子、增強子、polyA位點等重要結(jié)構(gòu)。帶gDNA Remover逆轉(zhuǎn)錄酶企業(yè)酵母菌逆轉(zhuǎn)錄酶是逆轉(zhuǎn)錄酶家族中的一個重要表示。
逆轉(zhuǎn)錄時試劑沒混勻會怎么樣?會出現(xiàn)起泡現(xiàn)象。RT-PCR的試劑都應在冰上融化,等完全融化后再?。挥眠^的試劑應瞬間離心后放回-20℃保存;試劑應按順序加,加完后再混勻離心。使用ReverTra-Ace、RNase-Inhibitor等酶類時,沒有混勻,會出現(xiàn)起泡現(xiàn)象;由于酶保存液中含有50%的甘油,粘度高,分取時應慢慢吸取。miRNA的RT-PCR:1)引物稀釋:miRNARTPrimer儲存液濃度:10μM。miRNARTPrimer工作液濃度:2μM。RTPrimer工作液配置:5μLRT-primer儲存液+45μLDEPC水。miRNA前后引物的工作液(10μM)用儲存液(100μM)稀釋后分裝,放入-20℃冰箱保存,避免反復凍融。
多逆轉(zhuǎn)錄酶都具有多種酶活性,DNA指導的DNA聚合酶活性;以反轉(zhuǎn)錄合成的首先條DNA單鏈為模板,以dNTP為底物,再合成第二條DNA分子。除此之外,有些反轉(zhuǎn)錄酶還有DNA內(nèi)切酶活性,這可能與病毒基因整合到宿主細胞染色體DNA中有關(guān)。反轉(zhuǎn)錄酶的發(fā)現(xiàn)對于遺傳工程技術(shù)起了很大的推動作用,目前它已成為一種重要的工具酶。用組織細胞提取mRNA并以它為模板,在反轉(zhuǎn)錄酶的作用下,合成出互補的DNA(cDNA),由此可構(gòu)建出cDNA文庫(cDNalibrary),從中篩選特異的目的基因,這是在基因工程技術(shù)中較常用的獲得目的基因的方法。HIV病毒復制的一個重要步驟就是逆轉(zhuǎn)錄。
逆轉(zhuǎn)錄常見問題及解決方法之組織提?。篟NAisolater可以提取miRNA嗎?可以提取miRNA。他普遍適用于培養(yǎng)細胞、動物組織、微生物以及代謝較少的植物組織,如幼苗、幼葉等。提取的RNA有基因組DNA污染:a)、向裂解液中加入氯仿后,需要在低溫下(2-8°C)高速離心。離心后,RNA被抽提到上層的水相中,中、下層是有機相,含有氯仿。DNA即存在于中層。氯仿在常溫下會與水以一定比例互溶,因此,常溫離心會導致上層水相中也有少量基因組DNA污染。吸取上層液體時,應非常小心,避免吸到中間層和下層,為此失去一點得率,保留一些上清不吸是非常值得的。RNA應如何保存:建議分裝后在-80℃長期保存,在-20℃可以短期保存,但需要盡快使用。逆轉(zhuǎn)錄實驗中的RNA樣品處理時要避免使用酸性物質(zhì)、有機溶劑和酶切酶劑。武漢莖環(huán)法逆轉(zhuǎn)錄哪家劃算
逆轉(zhuǎn)錄實驗時要記錄反應體系的溫度、時間、反應試劑的添加量等參數(shù)。一體化逆轉(zhuǎn)錄試劑RNA提取
RT-PCR逆轉(zhuǎn)錄引物設計原則:1.上下游引物要保守:擴增子長度需選擇一段保守片段(100-200bp)進行PCR擴增,選擇片段需跨越內(nèi)含子,因內(nèi)含子的基因組DNA序列不會被擴增,也可減少從污染的基因組DNA中擴增得到的假陽性風險。引物選取同樣需要保守。2.引物長度和Tm值:引物設計長度為18-25bp,Tm值在50-65℃之間,引物中GC含量在40-60%。設計引物時盡量避免出現(xiàn)4個或超過4個G堿基。RT-PCR實驗陰性對照:反轉(zhuǎn)錄陰性對照應包括在所有的RT-PCR的實驗中,用來檢測DNA是否污染(如基因組DNA或PCR產(chǎn)物)。該對照所指不加反轉(zhuǎn)錄酶,通過反轉(zhuǎn)錄過程得到cDNA在進行熒光定量PCR檢測。如檢測到擴增,則樣本中可能含有基因組DNA污染。一體化逆轉(zhuǎn)錄試劑RNA提取
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